炉水循环泵在启动前必须注意充分排空，排出电动机腔室中所有的空气。避免在正常运行中由于气泡的存在，使局部过热而损坏电动机的绝缘。所以必须严格遵循正确的注水操作步骤，要控制注水的水质和注水流量，并在注水完毕后，按照规定的次数(一般3次)点转排空，才能完全排出电动机腔室内的空气。
机组每次正常启动，在电动机注水完毕后，要测量电动机的绝缘是否在正常范围内，一般炉水循环泵的绝缘值比普通电动机高很多。绝缘值的降低意味着电动机的绝缘有损坏的迹象，必要时要进行检查。
正常运行中，必须保证电动机高压冷却器有充足的冷却水。一般是用闭式冷却水提供的，闭式冷却水的流量要保证，否则由于高温炉水的热传导作用，将使电动机绕组温度升高到损坏绝缘的程度。一般，炉水循环泵装设闭式冷却水流量保护，在闭式冷却水失去的情况下，使炉水循环泵跳闸，并关闭炉水循环泵出、入口阀，尽量减少炉水的热传导。
运行中，还要保证电动机的注水管路严密不漏，否则高压、高温的炉水将返回电动机，造成电动机绝缘高温损坏。
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